夫妻離異並不影響雙方申報扶養子女免稅額的權益。財政部表示，即使未擁有監護權，在辦理所得稅申報時，亦可列報子女扶養免稅額，但雙方須經協議，並以不重複列報為原則，以免事後被剔除補稅。
100年個人綜合所得稅申報季，將在今（101）年5月登場，隨著單親家庭已非社會少見情況，財政部提醒離異夫妻可事先協調子女的免稅額申報方式，以利5月時辦理申報。
稅捐機關實務上也常在報稅期間接獲民眾查詢，其綜合所得稅結算申報欲申報扶養與前夫（或妻）的婚生子女，但因子女監護權歸屬前夫（或妻），擔心因此被稽徵機關剔除免稅額。
財政部強調，依據民法規定，直系血親相互負有扶養義務，父母親對於未成年子女的扶養義務，不會因結婚經撤銷或離婚而受影響。因此，夫妻離婚後，未擔任未成年子女權利義務的行使或負擔之一方，對未成年子女依舊負有扶養義務，成年子女如不能維持生活且無謀生能力者亦同。
財政部表示，夫妻離異後，若雙方均有扶養子女的具體事實，如提供生活、就學資金等，在申報個人綜合所得稅時，即均具備列報子女扶養親屬免稅額的權利。
財政部強調，夫妻離婚後享有申報子女扶養親屬免稅額，任一方不論擔任或未擔任對未成年子女權利義務的行使或負擔，法律地位均無分軒輊，不會因有無擁有監護權，而有優先他方申報的情形。